Флуоресцентні барвники - це сполуки зі спеціальними структурами, і їх структурні особливості в основному включають такі три моменти:
(1) Молекула містить флуоресцентно-випромінюючу групу, таку як карбонільна група, подвійний зв’язок азот-азот, подвійний зв’язок вуглець-азот тощо.
(2) Молекула містить ауксохромні групи. Ауксохромна група робить спектр червоним зсувом і підвищує ефективність флуоресценції, наприклад, первинна аміногрупа, вторинна аміногрупа, гідроксильна група, ефірний зв’язок, амідна група тощо.
(3) Молекула містить спряжені π-зв’язки з жорсткою плоскою структурою. Чим більше внутрішньомолекулярна кон'югована система, тим сильніша планарність, тим вища інтенсивність флуоресценції. Деякі фактори, які можуть поліпшити ступінь кон'югації, можуть підвищити ефективність флуоресценції та зрушити довжину хвилі флуоресценції в довгохвильовий напрямок.
